Para compilar, simplesmente use a opção de configuração --with-mysql[=DIR] aonde o parãmetro opcional [DIR] aponta para o diretório onde o MySQL esta instalado.
Mesmo sendo esta extensão MySQL compativel com MySQL 4.1.0 e posterior, ela não suporta a funcionalidade extra que estas versões proveem. Para isto, use a extensão MySQLi.
Se você quiser instalar a extensão mysql em conjuno com a extnsão mysqli você deve usar a mesma biblioteca de cliente para evitar quaisquer conflitos.
A opção --with-mysql é ativada por padrão. Este é o funcionamento padrão e pode ser desabilitado com a opção de configuração --without-mysql . Se o MySQL for ativado sem especificar o caminho para o diretório de instalação do MySQL, o PHP irá usar a biblioteca de cliente MySQL embutida.
Usuários que executam outras aplicações que usam o MySQL (por exemplo, auth-mysql) não devem usar a biblioteca embutida, mas ao invés especificar o caminho para o diretório de instalação do MySQL, assim: --with-mysql=/path/to/mysql . Isto irá forçar o PHP a usar as bibliotecas de cliente instaladas pelo MySQL, assim evitando quaisquer conflitos.
A extensão do PHP MySQL é compilada no PHP.
O MySQL não é mais ativado por padrão, assim a DLL php_mysql.dll deve ser ativada dentro do php.ini. Também, o PHP precisa acessar a biblioteca de cliente do MySQL. Um arquivo chamado libmysql.dll é incluso na distribuição PHP do Windows e para permitir que o PHP converse com o MySQL este arquivo precisa estar disponível para o sistema Windows na variavél de ambiênte PATH. Veja o Faq intitulado "Como eu adiciono o meu diretório PHP no PATh no Windows" para informação de como fazer isto. Mesmo que copiar libmysql.dll para o diretório de sistema do Windows também (porque o diretório de sistema esta por padrão no PATH do sistema), isto não é recomendado.
Do mesmo jeito que ativar qualquer extensão do PHP (como php_mysql.dll), a diretiva do PHP extension_dir deve estar definida para o diretório aonde as extensões do PHP estão localizadas. Veja também Instruções de instalação Manual no Windows. Como um exemplo de valor para extension_dir para o PHP 5 é c:\php\ext
Nota:
Se ao iniciar o servidor web acontecer um erro similar a este: "Unable to load dynamic library './php_mysql.dll'", isto é porque php_mysql.dll e/ou libmysql.dll não pode ser encontrada pelo sistema.
Quebras e problemas de inicilização do PHP podem ser encontrados ao carregar esta extensão em conjunto com a extensão recode. Veja a extensão recode para maiores informações.
Nota:
Se você precisar de conjuntos de caracteres diferntes de latin (padrão), você terá que instalar um libmysql externa (não embutida) com o suporte ao conjunto de caracteres compilado.